试了下，没问题啊？

<input type="checkbox" value="0"/>
<input type="checkbox" value="1"/>
<input type="checkbox" value="2"/>
<input type="checkbox" value="3"/>
<input type="checkbox" value="4"/>
<input type="checkbox" value="5"/>
<script>
    var codeArr = [0,3,5];
    for(var i=0;i<codeArr.length;i++){
        var tem = codeArr[i];
        $("input:checkbox[value='"+tem+"']").attr("checked","checked");
    }

</script>

对checkbox进行选中状态更改时不要使用attr方法，从官方文档中可以找到， checked是一个boolean值，所以应该使用prop方法修改其值。
类似的属性还有readonly等

html

<input type="checkbox" value="0"/>
<input type="checkbox" value="1"/>
<input type="checkbox" value="2"/>
<input type="checkbox" value="3"/>
<input type="checkbox" value="4"/>
<input type="checkbox" value="5"/>

script

let values = [0 , 1 ,2];
for(let i=0,len=values.length;i<len;i++) {
  let value = values[i];
  $('input[type="checkbox"][value="'+value+'"]').prop('checked' ,true)
}